Добрый день, год назад лечила зубы 4 и 5ку справа (в 5 был поставлен штифт), после лечения чувствовался небольшой дискомфорт и я нащупала на десне в самом верху шишечку (фото прилагаю), внешне она почти незаметна, но при прощупывании пальцами ощущается, твердая как кость....

Только по прицельному снимку,фото и описанию ситуации ,на мой взгляд недостаточно исходной информации для точного ответа.Для лучшего понимания ситуации ,нужно анализировать КТ послойно во всех трех плоскостях. Прицельный снимок ,одноплоскостной и не передает всех нюансов происходящего. Но судя по снимку и фото ,скорее всего у верхушки корня имеется воспалительный процесс хронический,возможно усугубляет ситуацию не много выведенный за верхушку корня,пломбировочный материал. Поищите, через друзей и знакомых, по отзывам, сарафанное радио, лучший источник информации, грамотного ,опытного стоматолога терапевта эндодонтиста (специализируется на лечении каналов), с хорошими рекомендациями ,которому можно доверять и покажитесь на очный осмотр.Доктор все проверит,сделает необходимые обследования (КТ) и будет понятен дальнейший план действий.Лучше с этим не затягивать,пока зуб не разболелся.Это мое мнение, послушайте, пожалуйста, что посоветуют
коллеги тут на сайте, возможно, предложат другие варианты решения вопроса.